输血科是医院独立一级科室，是供血、管理、检验为一体的交叉学科科室。科室按照河南省血库标准化建设要求配置，近年来得到快速发展，荣获河南省输血管理先进单位。另外还承担城区一级医疗机构、民营医院和部分卫生院供血和指导用血工作。我院输血科是南阳市疑难血型鉴定和疑难配血指导中心。
输血科现有工作人员17人，其中高级职称1人，中级3人，初级13人；其中硕士研究生1人，执业医师2人。
输血科位于综合病房大楼三楼，单独区域，总面积三百多平方米，环境洁净、布局合理，临近手术室和病区。设有发血室、储血室、质控室、配血室、无菌室、接诊室、更衣室、值班室、库房、处置室、输血档案室、送血服务室、主任办公室。
输血科严格按照《中华人民共和国献血法》、《卫生部医疗机构临床用血管理办法》、《卫生部临床输血技术规范》等进行工作，开展所有血型血清学检查项目，ABO亚型鉴定，新生儿溶血病、孕产妇抗体效价，开展疑难配血和疑难血型鉴定。
输血科参加卫生部室间质评项目，连续七年成绩全部为优秀；主动参加上海血液中心举办的国家血型参比实验室室间质评项目全部合格。
输血科与医务科、护理部、质检科共同管理输血工作，每年指导临床合理用血不低于50次，参与医院业务查房检查不低于100次，每年输血管理通报超过12期。输血科按计划培养输血医师，开展输血评估，推行临床科室和医师用血评价及公示制度并进行用血权限管理。注重科技论文的书写，鼓励研究生搞好科研，每年在国家级杂志发表论文4篇以上，每年申报一项市级科技成果。
截至2014年底，我院年供血量最高达9吨约900万毫升，全年成分输血率平均在99%以上，输血安全事故率为0。
输血科是南阳团市委命名的“青年文明号”科室，是河南省输血会员单位，连年被市卫生局评为先进单位。